Преди пандемията от коронавирус, пренебрегнати улики от китайски учени

В края на декември 2019 г. осем страници от генетичен код бяха изпратени до компютри в Националния институт по здравеопазване в Бетесда, Мериленд

Без знанието на американските служители по онова време, генетичната карта, която се е приземила на прага им, съдържа критични улики за вируса, който скоро ще предизвика пандемия.

Генетичният код, изпратен от китайски учени в огромно публично хранилище на данни за секвениране, управлявано от правителството на САЩ, описва мистериозен нов вирус, който е заразил 65-годишен мъж седмици по-рано през Ухан. По времето, когато кодът е изпратен, китайските власти все още не са предупредили за необяснима пневмония, разболяваща пациенти в централния град Ухан.

Но хранилището на САЩ, което е проектирано за да помогне на учените да споделят обикновени изследователски данни, никога не е добавял подаването, което е получил на 28 декември 2019 г., към своята база данни. Вместо това той поиска от китайските учени три дни по-късно да изпратят отново кода с някои допълнителни технически подробности. Това искане остана без отговор.

работете заедно, за да публикувате генетичния код на новия коронавирус онлайн, като поставите началото на неистови глобални усилия за спасяване на животи чрез създаване на тестове и ваксини.

Китайското правителство заяви, че незабавно е споделило генетичния код на вируса с глобалните здравни служители. Републиканците в Камарата на представителите заявиха, че новите документи показват, че това е невярно. Новинарски акаунти и публикации в китайските социални медии отдавна съобщават, че вирусът е бил секвениран за първи път в края на декември 2019 г.

Но законодатели и независими учени казаха, че документите наистина предлагат изкушаващи нови подробности за това кога и как учените за първи път се опитаха да споделят тези последователности в световен мащаб, илюстрирайки трудностите, които Съединените щати изпитват при избирането на тревожни патогени от хилядите обикновени генетични последователности, които се изпращат в тяхното хранилище всеки ден.

по-ранно писмо до Камарата на републиканците , Мелани Ан Егорин, старши служител на Министерството на здравеопазването, каза, че последователността първоначално е била подложена на „технически, но не научен или обществен здравен преглед“, както е обичайно. След като не получи отговор от китайските учени за исканите корекции, базата данни, известна като GenBank, автоматично изтри подаването от своята опашка с непубликувани последователности на 16 януари 2020 г.

Не е ясно защо китайските учени не са отговорили. Един от подателите, Лили Рен, която е работила в институт за патогени в рамките на държавната Китайска академия на медицинските науки в Пекин, не отговори на искане за коментар. Китайското посолство каза, че отговорът на Китай е „научно базиран, ефективен и в съответствие с националните реалности на Китай.“

Но същата последователност, която групата на д-р Рен изпрати до GenBank, беше направена публичен в друга онлайн база данни, известна като GISAID, на 12 януари 2020 г., малко след като други учени публикуваха първия код на коронавирус. Групата на д-р Рен също изпрати отново коригирана версия на кода на GenBank в началото на февруари и публикува документ, описващ работата му.

Казаха републиканските лидери на комисията по енергетика и търговия на Камарата на представителите.

Джеси Блум, вирусолог от онкологичния център "Фред Хътчинсън" в Сиатъл, каза, че генетичната последователност би подсказала силно на всеки, който я прегледа в края на декември 2019 г., че нов коронавирус причинява мистериозните случаи на пневмония в Ухан. Вместо това официалните китайски графики показват, че правителството не е поставило тази диагноза до началото на януари.

„Ако тази последователност беше предоставена, вероятно прототипните ваксини можеха да бъдат започнати веднага и това беше две седмици по-рано, отколкото бяха започнати,” каза д-р Блум. в произхода на вируса, казаха д-р Блум и други учени, като се има предвид, че последователността не съдържа специални улики за еволюцията на вируса и по-късно така или иначе беше оповестена публично.

Но те предлагат нови подробности за темпото, с което екипът на д-р Рен е работил за секвенирането на вируса. Натривката, съдържаща анализирания от тях вирус, е взета от 65-годишния пациент, продавач на големия пазар, където за първи път е забелязано разпространението на болестта, на 24 декември 2019 г. В рамките на четири дни учените изпратиха генетичните данни на вируса до GenBank.

блог в края на януари 2020 г., че въпреки че е идентифицирала нов вирус в болнични проби, това само по себе си не демонстрира, че вирусът причинява случаи на пневмония, което забавя официалното съобщение.

В началото на 2020 г. китайското правителство също издаде директиви, обезсърчаващи определени линии на научни изследвания и ограничи пускането на данни за вируса.

Дори веднъж генетичният код на вируса беше изпратен в хранилището на САЩ, щеше да е трудно за американските служители, работещи в изследователската база данни, да го забележат. Хранилището съдържа стотици милиони генетични последователности. Голяма част от процеса на проверката им е автоматизиран.

И поне докато китайските власти не започнаха да алармират в самия край на декември 2019 г., почти никой нямаше да разбере потърсете нов коронавирус сред купчините заявки.

„По онова време нямаше начин някой от N.C.B.I. би осъзнал важността на това“, каза Александър Критс-Кристоф, изчислителен биолог, позовавайки се на N.I.H. център, който управлява GenBank. Освен това, каза той, генетични хранилища като GenBank трябва да внимават за публичното разгласяване на последователности, като се има предвид, че изследователите често използват едни и същи данни, за да подготвят статии в списания.

Все пак , някои учени смятат, че американските и световните здравни служители са били бавни с модернизирането на бази данни като GenBank, за да им позволят да се възползват от последователности, които биха могли да имат критични последици за общественото здраве.

Такава базата данни може например автоматично да сканира за нови патогени, чиито генетични кодове се припокриват с онези, за които е известно, че са опасни, каза д-р Камил. И може да гарантира, че тези последователности се разпространяват по-широко, дори когато здравните служители чакат липсващи подробности или ревизии.

„Оставете тези последователности на портиерски грижи, боже мой“, той казах. „Защо агенциите, отговарящи за общественото здравеопазване или глобалното здравеопазване, не засилиха играта си и не казаха: „Това е 2024 г., трябва да сме по-безопасни, така че подобни неща да не се случват отново?“